Tijdens de tweede wereldoorlog had schrijver Maurice Bendix (Ralph Fiennes) een passionele relatie met Sarah Miles (Julianne Moore), de vrouw van een Britse politicus.Tijdens één van hun vele seksuele ontmoetingen, slaat er plots een V1 bom in op hun liefdesnestje en daarop maakt Sarah een abrupt einde aan hun relatie.

Ongeveer 2 jaar later ontmoet Maurice Sarahs man Henry Miles (Stephen Rea) en als hij hem naar huis begeleidt, ontmoet hij Sarah opnieuw. De oude gevoelens laaien opnieuw op. Deze keer heeft Maurice wel vernomen van Henry dat zijn vrouw hem waarschijnlijk bedriegt en vol van jaloezie huurt hij de privé-detective Mr.Parkis (Ian Hart) in om Sarah te schaduwen.

In het eerste deel van de film zien we dit verhaal vanuit het standpunt van Maurice die wil weten waarom ze destijds een einde aan hun verhouding heeft gemaakt.
In het tweede deel zien we het verhaal aan de hand van het dagboek van Sarah, dat door de detective aan Maurice werd gegeven. Nu zien we een heel ander en onthullend verhaal, dat Maurice doet inzien dat ze nog zeer veel van hem houdt.
In het derde deel zien we hoe deze emotionele thriller overgaat in een soort theologische thriller, waarin zelfs een klein menselijk mirakel geschiedt.
De Ier Neil Jordan kennen we reeds van Mona Lisa. Hij kreeg in 1992 een Oscar voor de film The Crying Game en met The End of the Affair levert hij weer een soort thriller af die boeit tot het einde. Hij schreef ook het scenario naar de deels autobiografische roman met dezelfde titel van Graham Greene en heeft daarbij een wat mildere en elegantere toon gehanteerd dan in de roman zelf. Zo worden de andere verhoudingen die Sarah met meerdere priesters had niet vermeld en ook de homoseksuele aantrekkingskracht tussen Maurice en Henry wordt niet uitgediept. Van de sadomasochistische drijfveren van Maurice en Sarah is ook niets te merken. Er zit wel seks in het verhaal -maar die is van een zeer menselijke en mooie vorm.